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We have a variety of funding sources: ANR, private partnerships, institutional (INRAE, SPS) and income from rapeseed variety characterization services.
2024 – 2026 Projet collaboratif avec BASF INTERpOSE
‘Functional characterization of molecular determinants involved in atypical gene-for-gene interactions between oilseed rape and its fungal pathogen Leptosphaeria maculans’.
Coordination : I. Fudal
2022 – 2026 Thèse CIFRE de Camille Rabeau avec Innolea
Encadrement : I. Fudal, A. Jiquel et S. Faure
2022-2023 « ATHENA »
Adaptation of L. maculans to host infection: impact of the chromatin dynamics on Expression of pathogeNicity relAted genes
Coordination : J. Soyer
Financement : SPS
2022-2023 « ARSEN »
Analyse de la reproduction sexuée chez Leptosphaeria maculans, agent phytopathogène du colza
Coordination : T.S. Nguyen
Financement : INRAE SPE
2021-2026 « Club Phoma »
Projet de recherche collaboratif portant sur le déploiement et la gestion raisonnée de résistances variétales du colza au Phoma, dans un objectif de durabilité
Financement : UFS (Union Française des Semences)
Partenaires : UFS (Union Française des Semences)
2021-2025 « STARlep »
Élargir le répertoire des protéines d'avirulence structuralement conservées chez les champignons phytopathogènes pour améliorer la gestion des résistances des plantes.
Coordination : I.Fudal
Partenariat : I2BC, ICSN, Innolea
Financement : ANR PRCE
2020-2026 « DEEP-IMPACT »
Deciphering plant microbiota interactions to enhance crop defenses to pests.
Financement : PPR « Cultiver Protéger Autrement »
2020-2024 "CHOPIN"
"Deciphering in planta CHrOmatin dynamics of a Phytopathogenic fungus during Infection"
Coordination: J. Soyer
Partenariat : IPS2, UMR INRA-CNRS-UEVE, Equipe Chromosome Dynamics (C. Raynaud)
Financement : ANR
2020-2022 « GRACeFUL » (Gene ResistAnce Communauté FongiqUe Leptosphaeria)
Impact d’un gène de résistance spécifique sur les communautés fongiques associées à la plante-hôte : cas d’une résistance du colza à Leptosphaeria maculans.
Coordination : V. Laval
Financement : INRAE SPE
2019-2021 « Resistrans »
Exploitation d’effecteurs « transgenres » pour l’obtention de résistances à large spectre
Coordination : I. Fudal
Financement : INRAE SPE
2019-2021 « Flirt »
Biologie et analyse FonctionnelLe des InteRactions Tripartites colza-Leptosphaeria maculans - Leptosphaeria biglobosa
Coordination : T. Rouxel
Financement : INRAE SPE
2019-2021. “Atipical"
“Actualisation et pérennisation des connaissances et des ressources biologiques et moléculaires sur les maladies foliaires de colza”
Coordination : MH. Balesdent
Partenariat : Terres Inovia (A. Penaud), Geves (P. Bagot), INRA IGEPP (L. Bousset)
Financement : Casdar (Ministère en charge de l’agriculture)
2018-2019. “ChromaDyn"
“Deciphering the influence of chromatin dynamics on the expression of effector genes in a leaf-penetrating fungal pathogen”
Coordination : I. Fudal
Financement : INRA SPE
2017-2019. “Phytoadapt"
“Adaptation à de nouvelles espèces non-hôtes chez les champignons phytopathogènes des grandes cultures”
Coordination : JL. Soyer
Financement : INRA SPE
2017-2019. “MoGeR"
“Des connaissances à la modélisation : vers un outil de simulation convivial pour tester des scénarios de gestion des résistances variétales dans le cas du Phoma du colza”.
Coordination : MH. Balesdent
Partenariat : Agrosolutions groupe InVivo, INRA-BIOGER (F. Carpentier, BIOGER, Equipe "Epidémiologie des maladies fongiques du blé"), INRA-ISA (S. Touzeau)
Financement : INRA metaprogramme SMaCH
2016. "Effector evolution across diverse (phytopathogenic) fungal genomic landscapes".
Accueil de Ralph Dean, senior scientist, à BIOGER.
Coordination : T. Rouxel
Financement : INRA SPE
2015-2018. “StructuraLep".
“Structural and functional characterization of Leptosphaeria maculans effectors and of their interactants”.
Coordination : I. Fudal
Partenariat : UMR CNRS-CEA-Université Paris-Sud I2BC
Financement : ANR (Appel « Génériques, Défi sociétal: Sécurité alimentaire et défi démographique”)
2015-2019. “MetaPhoR"
“Exploitation des données de métatranscriptomique issues de “LeptoLife" pour l’identification et le suivi de nouvelles sources de résistance au phoma chez le colza”
Coordination : T. Rouxel
Partenariat : INRA-IGEPP, Genoscope
Financement : Promosol
2015-2017. “DynamiC-Rlm7"
“Territoires, idéotypes et dynamique adaptative : acquisition de critères d'objectivation de l'état du contournement de la résistance Rlm7 du colza au phoma”
Coordination : MH. Balesdent
Partenariat : In Vivo-Agrosolutions
Financement : Projet ANR du Labex BASC, appel “innovation en partenariat”
2014-2017. Bourse de thèse de Julie Gervais
“Identification et analyse fonctionnelle des effecteurs tardifs impliqués dans la colonisation systémique du colza par Leptosphaeria maculans”
Coordination : MH. Balesdent
Directeur de thèse : T. Rouxel
Co-financement : INRA-CETIOM
2014-2015. “La distribution des nucléosomes chez les champignons filamenteux phytopathogènes joue-t-elle un rôle dans le contrôle de l’expression des effecteurs ?”
Coordination : I. Fudal
Partenariat : UR INRA MYCSA.
Financement : INRA SPE
2014. Projet France Génomique “LeptoLife”
“Un projet de transcriptomique et de métagénomique pour explorer les phases “cachées” du cycle infectieux de Leptosphaeria maculans”
Coordination : T. Rouxel
Partenariat : UMR INRA-IGEPP, Genoscope.
Financement : France génomique
2013-2017. ANR “GANDALF”
“Génomique et adaptation des traits d’histoire de vie des champignons impliqués dans les interactions avec la plante hôte”
Coordination : François Delmotte (INRA Bordeaux)
Partenariat : ESE, INRA-BGPI, INRA-BIOGER (EPLM + équipe Epidémiologie), INRA-SAVE, INRA-IAM, INRA-BIOGECO, IRHS, INRA-URGI, LIPM
Financement : ANR (BioAdapt)
2013-2014. “Caractérisation temporelle du cortège de micro-organismes associés aux résidus de culture de colza infectés par Leptosphaeria maculans”
Coordination : V. Laval
Financement : INRA SPE
2012-2016 : Projet CTPS “ICoSCoP”.
“Intégration des nouvelles connaissances sur les interactions plantes-champignon pour développer des stratégies de gestion des résistances du colza au Phoma”
Coordination : MH. Balesdent
Partenariat : F. Carpentier (BIOGER, Equipe "Epidémiologie des maladies fongiques du blé"), R. Delourme (INRA-IGEPP), M. Leflon (Terres Inovia), M-H. Jeoffroy (INRA Agronomie)
Financement : ONEMA (suite à AAP Casdar CTPS)
2012-2016 : "K-Masstec"
“Knowledge-driven design of management strategies for stem canker specific resistance genes”.
Coordination : MH. Balesdent
Partenariat : F. Carpentier (BIOGER, Equipe "Epidémiologie des maladies fongiques du blé"), R. Delourme (INRA-IGEPP), M. Leflon (Terres Inovia)
Financement : MétaProgramme INRA SMaCH
2010-2014 : “Caractérisation de gènes de résistance, de gènes d’avirulence et de facteurs d’agressivité dans l’interaction L. maculans-colza”
Coordination : MH. Balesdent
Financement : CETIOM (terres Inovia)
2010-2013. ANR “Fungisochores”
“Isochores and effectors: genome reshaping and the birth of highly pathogenic species in fungal phytopathogens”
Coordination : T. Rouxel
Partenariat : INRA URGI (Versailles), INRA-PACE (Angers).
Financement : ANR
2008-2011: ANR Génoplante AVirLep
“A whole-genome-based search for Leptosphaeria maculans avirulence and aggressiveness genes to improve management of resistance genes of oilseed rape to stem canker disease”.
Coordinateur : MH. Balesdent
Partenariat : INRA IGEPP (H. Brun, R. Delourme, A-M. Chèvre), CETIOM-Terres Inovia (X. Pinochet), Biogemma (B. Grezes-Besset).
Financement : ANR Génoplante
